Menüyü değiştir
Toggle preferences menu
Kişisel menüyü aç / kapat
Oturum açık değil
Your IP address will be publicly visible if you make any edits.

Lizozom ve Peroksizom: Revizyonlar arasındaki fark

TİKİPedi sitesinden
"<span id="hücrenin-iktisat-sanatı-lizozom-ve-peroksizom-merkezli-geri-dönüşüm-ve-kalite-kontrol-sistemleri"></span> = '''Hücrenin İktisat Sanatı: Lizozom ve Peroksizom Merkezli Geri Dönüşüm ve Kalite Kontrol Sistemleri''' = <span id="giriş"></span> == '''Giriş''' == Canlılığın temel birimi olan hücre, son derece organize ve kaynaklarını azami verimlilikle kullanan dinamik bir sistem olarak karşımıza çıkar. Bu mikro-evrenin de..." içeriğiyle yeni sayfa oluşturdu
 
TikipediBot (mesaj | katkılar)
k Biyoloji kategorisi eklendi.
 
(Bir diğer kullanıcıdan bir ara revizyon gösterilmiyor)
33. satır: 33. satır:
===== '''Biyogenez ve Enzim Hedeflenmesi: Mannoz-6-Fosfat Posta Kodu''' =====
===== '''Biyogenez ve Enzim Hedeflenmesi: Mannoz-6-Fosfat Posta Kodu''' =====


Lizozomal hidrolazlar, diğer birçok protein gibi granüllü endoplazmik retikulumda (GER) sentezlenir ve ardından işlenmek üzere Golgi aygıtına taşınır.1 Burada, bu enzimlerin doğru adrese, yani lizozoma gönderilmesini sağlayan son derece spesifik bir “adresleme” süreci işler. Golgi’nin
Lizozomal hidrolazlar, diğer birçok protein gibi granüllü endoplazmik retikulumda (GER) sentezlenir ve ardından işlenmek üzere Golgi aygıtına taşınır.1 Burada, bu enzimlerin doğru adrese, yani lizozoma gönderilmesini sağlayan son derece spesifik bir “adresleme” süreci işler. Golgi’nin ''cis'' bölümünde, lizozomal enzimler olarak belirlenmiş proteinlere özgü bir “adres etiketi” olan Mannoz-6-Fosfat (M6P) işareti eklenir. Bu işaretleme, N-asetilglukozamin fosfotransferaz adı verilen bir enzim tarafından gerçekleştirilir.1
 
''cis'' bölümünde, lizozomal enzimler olarak belirlenmiş proteinlere özgü bir “adres etiketi” olan Mannoz-6-Fosfat (M6P) işareti eklenir. Bu işaretleme, N-asetilglukozamin fosfotransferaz adı verilen bir enzim tarafından gerçekleştirilir.1


Daha sonra, Golgi’nin ''trans'' bölümünde bulunan M6P reseptörleri, bu M6P ile etiketlenmiş enzimleri tanır ve onları seçici olarak bağlar. Bu reseptör-enzim kompleksleri, klatrin kaplı veziküller içerisine paketlenerek endozomal/lizozomal yolağa yönlendirilir.11 Bu hassas tanıma ve paketleme sistemi, yüzlerce farklı proteinin üretildiği bir ortamda, sadece lizozoma ait olanların hatasız bir şekilde ayrıştırılıp doğru hedefe teslim edilmesini sağlar. Bir proteinin üzerindeki küçük bir kimyasal modifikasyonun (fosfatlanmış şeker), onun nihai kaderini etkilemesi, moleküler düzeyde işleyen bir “posta servisi” ve “lojistik” ağının kurulmuş olduğunu gösterir.
Daha sonra, Golgi’nin ''trans'' bölümünde bulunan M6P reseptörleri, bu M6P ile etiketlenmiş enzimleri tanır ve onları seçici olarak bağlar. Bu reseptör-enzim kompleksleri, klatrin kaplı veziküller içerisine paketlenerek endozomal/lizozomal yolağa yönlendirilir.11 Bu hassas tanıma ve paketleme sistemi, yüzlerce farklı proteinin üretildiği bir ortamda, sadece lizozoma ait olanların hatasız bir şekilde ayrıştırılıp doğru hedefe teslim edilmesini sağlar. Bir proteinin üzerindeki küçük bir kimyasal modifikasyonun (fosfatlanmış şeker), onun nihai kaderini etkilemesi, moleküler düzeyde işleyen bir “posta servisi” ve “lojistik” ağının kurulmuş olduğunu gösterir.
136. satır: 134. satır:
Otofaji sitoplazmanın rastgele bir bölümünü hedef almaz. Hücre, belirli kargoları özel olarak tanıyıp hedefe yönelik olarak imha etme yeteneğine sahiptir. Bu “seçici otofaji” süreçlerinin en iyi bilinen örneklerinden biri, hasarlı veya işlevini yitirmiş mitokondrilerin “mitofaji” yoluyla temizlenmesidir.1
Otofaji sitoplazmanın rastgele bir bölümünü hedef almaz. Hücre, belirli kargoları özel olarak tanıyıp hedefe yönelik olarak imha etme yeteneğine sahiptir. Bu “seçici otofaji” süreçlerinin en iyi bilinen örneklerinden biri, hasarlı veya işlevini yitirmiş mitokondrilerin “mitofaji” yoluyla temizlenmesidir.1


Mitofaji sürecinde, zar potansiyelini kaybetmiş, yani işlevsel olarak hasar görmüş bir mitokondri, dış zarı üzerinde PINK1 adı verilen bir kinaz proteinini biriktirmeye başlar. Sağlıklı mitokondrilerde bu protein sürekli olarak parçalanırken, hasarlı olanlarda birikir. Biriken PINK1, sitozolde bulunan Parkin adlı bir E3 ubikitin ligazı aktive eder. Aktifleşen Parkin, hasarlı mitokondrinin yüzeyindeki çeşitli proteinleri “ubikitin” adı verilen küçük bir proteinle zincirler halinde etiketler.25 Bu ubikitin zincirleri, bir nevi “imha et” sinyali görevi görür. p62 ve NDP52 gibi otofaji reseptör proteinleri, bu ubikitin etiketlerini tanır ve etiketlenmiş mitokondriyi, oluşmakta olan fagoforun zarına bağlar. Böylece, sadece hasarlı olan mitokondri seçilerek imha edilmek üzere otofagozomun içine alınır.25 Bu mekanizma, bir “arama ve imha” görevini andırır: Sistem, (1) hasarı
Mitofaji sürecinde, zar potansiyelini kaybetmiş, yani işlevsel olarak hasar görmüş bir mitokondri, dış zarı üzerinde PINK1 adı verilen bir kinaz proteinini biriktirmeye başlar. Sağlıklı mitokondrilerde bu protein sürekli olarak parçalanırken, hasarlı olanlarda birikir. Biriken PINK1, sitozolde bulunan Parkin adlı bir E3 ubikitin ligazı aktive eder. Aktifleşen Parkin, hasarlı mitokondrinin yüzeyindeki çeşitli proteinleri “ubikitin” adı verilen küçük bir proteinle zincirler halinde etiketler.25 Bu ubikitin zincirleri, bir nevi “imha et” sinyali görevi görür. p62 ve NDP52 gibi otofaji reseptör proteinleri, bu ubikitin etiketlerini tanır ve etiketlenmiş mitokondriyi, oluşmakta olan fagoforun zarına bağlar. Böylece, sadece hasarlı olan mitokondri seçilerek imha edilmek üzere otofagozomun içine alınır.25 Bu mekanizma, bir “arama ve imha” görevini andırır: Sistem, (1) hasarı ''tespit eder'' (PINK1’in stabilizasyonu), (2) hasarlı nesneyi ''işaretler'' (Parkin ile ubikitinleme) ve (3) işaretlenmiş nesneyi ''toplar'' (reseptörler aracılığıyla). Bu, bilgiye dayalı bir eylemdir. “Hasarlı” olma bilgisi, moleküler bir “etikete” (ubikitin) dönüştürülmekte ve bu etiket, imha makinesini harekete geçirmektedir.
 
''tespit eder'' (PINK1’in stabilizasyonu), (2) hasarlı nesneyi ''işaretler'' (Parkin ile ubikitinleme) ve (3) işaretlenmiş nesneyi ''toplar'' (reseptörler aracılığıyla). Bu, bilgiye dayalı bir eylemdir. “Hasarlı” olma bilgisi, moleküler bir “etikete” (ubikitin) dönüştürülmekte ve bu etiket, imha makinesini harekete geçirmektedir.


<span id="güncel-araştırmalar-işığında-organeller-arası-iletişim-ve-hastalıklarla-ilişki"></span>
<span id="güncel-araştırmalar-işığında-organeller-arası-iletişim-ve-hastalıklarla-ilişki"></span>
269. satır: 265. satır:
# Mechanisms of Autophagy–Lysosome Dysfunction in Neurodegenerative Diseases Abstract - University of Cambridge, erişim tarihi Ağustos 2, 2025, https://www.repository.cam.ac.uk/bitstreams/24f3c9df-dbc3-469b-b3a2-d313eccef8eb/download<br />
# Mechanisms of Autophagy–Lysosome Dysfunction in Neurodegenerative Diseases Abstract - University of Cambridge, erişim tarihi Ağustos 2, 2025, https://www.repository.cam.ac.uk/bitstreams/24f3c9df-dbc3-469b-b3a2-d313eccef8eb/download<br />
# Peroxisome biogenesis, protein targeting mechanisms and PEX gene functions in plants - White Rose Research Online, erişim tarihi Ağustos 2, 2025, https://eprints.whiterose.ac.uk/id/eprint/90177/1/Cross%20et%20al%20FINALRevisionClean.pdf
# Peroxisome biogenesis, protein targeting mechanisms and PEX gene functions in plants - White Rose Research Online, erişim tarihi Ağustos 2, 2025, https://eprints.whiterose.ac.uk/id/eprint/90177/1/Cross%20et%20al%20FINALRevisionClean.pdf
[[Kategori:Biyoloji]]