İçeriğe atla

Amino Asitlerin Tanınması ve Analizi

TİKİPedi sitesinden

Analitik Ayrım Yöntemleri: Temel Mekanizmalar ve Kavramsal Bir Analiz

Giriş

Analitik bilimler alanı, maddenin bileşimini anlama çabasının temelini oluşturur. Bu alan içerisinde, ayrım teknikleri birincil bir öneme sahiptir; zira karmaşık karışımların tekil bileşenlerine ayrıştırılması, hem nitel tanımlama hem de nicel ölçüm için bir ön koşuldur.1 Bu rapor, bu temel ayrım görevinin yerine getirildiği dört farklı fakat kavramsal olarak ilişkili yöntemi inceleyecektir.

Raporun amacı, dört temel teknik olan Kağıt Kromatografisi, İyon Değişim Kromatografisi, Kağıt Elektroforezi ve Gaz Kromatografisi hakkında detaylı bir bilimsel izah sunmaktır. Her bir yöntemin işleyiş prensipleri, temel bileşenleri ve güncel bilimsel gelişmeler ayrıntılı olarak ele alınacaktır. Ardından, bu sistemlerin işleyişi aracılığıyla ortaya konan düzen, nedensellik ve bileşen parçalar ile onlardan ortaya çıkan işlev arasındaki ilişki temalarını keşfetmek üzere kavramsal bir analiz yapılacaktır. Raporun tamamı, belirli bir nedensellik anlayışını yansıtmak amacıyla, tutarlı bir şekilde edilgen ve süreci betimleyici bir dil kullanılarak özel bir dilbilimsel ve felsefi çerçeve içerisinde yapılandırılmıştır.4

Bilimsel Açıklama ve Güncel Bulgular

Düzlemsel Kromatografi: Kağıt Kromatografisi

Temel Kavramlar ve İşleyiş Mekanizması

Kağıt kromatografisi, bileşenlerin ayrımının partisyon (dağılım) ilkesine dayandığı düzlemsel bir kromatografi tekniği olarak sunulur.2 Bu yöntemde, bir karışımdaki bileşenler, birbiriyle karışmayan iki sıvı faz arasında farklı oranlarda dağıtılır.5

Sistemin iki temel fazı bulunmaktadır. Durağan faz, tipik olarak selülozdan oluşan ve gözenekli yapısı içinde sulu bir çözücüyü (su) tutan özel bir filtre kağıdı olarak tanımlanır.6 Selüloz lifleri tarafından tutulan bu su, durağan sıvı fazı teşkil eder.2

Hareketli faz ise, durağan fazın üzerinden hareket eden ve numune bileşenlerini beraberinde taşıyan bir sıvı çözücü veya çözücü karışımıdır.6 Çözücü sisteminin seçimi kritik bir öneme sahiptir ve ayrıştırılacak bileşiklerin kimyasal doğasına göre belirlenir; örneğin, amino asitlerin ayrımı için bir butanol-asetik asit-su sistemi kullanılabilir.5

Ayırma süreci, numune karışımından küçük bir noktanın kağıt üzerine uygulanmasıyla başlatılır.9 Ardından, kağıdın kenarı, çözücü buharıyla doygun bir atmosferin sağlandığı kapalı bir tank içindeki hareketli faza daldırılır.7 Hareketli faz, kılcal etki (kapiler etki) vasıtasıyla kağıt üzerinde yükselir veya alçalır.6 Çözücü cephesi numune noktasına ulaştığında, bileşenler çözülür ve hareketli fazla birlikte taşınmaya başlar.9

Ayırım, her bir bileşenin durağan su fazı ile hareketli organik çözücü fazı arasında farklı şekilde dağılmasıyla sağlanır. Durağan faza daha yüksek afinitesi olan (suda daha çok çözünen) moleküller daha kısa mesafeler kat ederken, hareketli faza daha yüksek afinitesi olan (çözücüde daha çok çözünen) moleküller kağıt üzerinde daha uzağa taşınır.5 Bu süreç, karışımın farklı konumlarda bir dizi belirgin lekeye ayrışmasıyla sonuçlanır.

Ayrılan her bir bileşenin konumu, Alıkonma Faktörü (Rf​) ile karakterize edilir. Bu değer, bileşenin kat ettiği mesafenin çözücü cephesinin kat ettiği mesafeye bölünmesiyle hesaplanan bir orandır.5

Rf​ değeri, belirli bir bileşik için sabit koşullar (sıcaklık, kağıt türü, çözücü sistemi) altında değişmez bir sabittir ve bu özellik, standartlarla karşılaştırma yoluyla nitel tanımlamaya olanak tanır.5

Güncel Araştırmalardan Bulgular

Tarihsel olarak temel bir teknik olmasına rağmen, kağıt kromatografisinin prensipleri güncelliğini korumaktadır. Düşük maliyetli, basit ve verimli bir teknik olması ve çok az miktarda numune gerektirmesi, onu eğitim ortamlarında ve biyokimya (amino asit ve şeker ayrımı), ilaç ve gıda analizi gibi alanlarda değerli kılmaktadır.8

Modern bilimdeki önemli bir gelişme, kağıdın fiziksel özelliklerinin (kılcal etki, gözenekli yapı) mikroakışkan kağıt tabanlı analitik cihazların (µPADs) tasarımında uygulanmasıdır.12 Bu cihazlar, kağıt tabanlı ayırımın teknolojik bir yeniden doğuşunu temsil etmekte ve kaynakları kısıtlı ortamlarda bakım noktası (POC) teşhisi için düşük maliyetli, taşınabilir platformlar sunmaktadır.14 µPAD’ler, numune hazırlama, sıvı taşıma ve tespit bölgelerinin tek bir kağıt çip üzerine entegre edilmesiyle, immünoassayler ve DNA tabanlı sıtma teşhisi gibi karmaşık biyolojik tahliller için tasarlanmıştır.12 Bu ilerleme, selüloz kağıt gibi bir malzemenin işlevsel potansiyelinin ilk uygulamasıyla tükenmediğini göstermektedir. Aynı temel fiziksel yasalar (kılcallık, dağılım), çok daha karmaşık ve işlevsel sistemler oluşturmak üzere daha hassas ve sanatsal bir şekilde yeniden kullanılabilmektedir. µPAD’lerin tasarımında, kağıt üzerine hidrofobik bariyerler desenlenerek hassas mikrokanallar, valfler ve reaksiyon bölgeleri oluşturulur. Bu desenleme, basit bir ayırma ortamını, HIV tespiti veya sıtma teşhisi gibi çok adımlı, otomatik tahliller yapabilen karmaşık bir “çip üstü laboratuvara” dönüştürür. Hammadde (kağıt) ve içindeki sıvı akışını sağlayan yasalar sabit kalırken, ilerleme, bu malzemenin daha karmaşık ve amaçlı bir şekilde düzenlenmesinden kaynaklanmakta ve sistemin özelliklerinde her zaman gizli olan daha yüksek bir işlevsellik seviyesini ortaya çıkarmaktadır.

Yük Temelli Ayrım: İyon Değişim Kromatografisi (IEC)

Temel Kavramlar ve İşleyiş Mekanizması

İyon Değişim Kromatografisi (IEC), yüklü moleküllerin (iyonlar, proteinler, nükleik asitler) zıt yüklü bir durağan faza karşı tersinir elektrostatik etkileşimlerine dayanarak ayrıldığı bir tekniktir.2 Temel mekanizma, hedef analit iyonları ile hareketli fazdaki diğer iyonlar arasında, durağan faz üzerindeki bağlanma bölgeleri için rekabetçi bir değişime dayanır.18

Durağan faz (İyon Değiştirici), üzerine yüklü fonksiyonel grupların kovalent olarak bağlandığı inert, gözenekli bir matristir (genellikle polistiren-divinilbenzen veya selüloz gibi çapraz bağlı polimerlerden oluşan bir reçine).17 Bu faz iki ana türe ayrılır:

  • Anyon Değiştiriciler: Pozitif yüklü fonksiyonel gruplara (örneğin, dietilaminoetil, DEAE) sahiptir ve negatif yüklü molekülleri (anyonları) bağlamak için kullanılır.2
  • Katyon Değiştiriciler: Negatif yüklü fonksiyonel gruplara (örneğin, karboksimetil, CM) sahiptir ve pozitif yüklü molekülleri (katyonları) bağlamak için kullanılır.2

Hareketli faz (Eluent) olarak sulu bir tampon çözelti kullanılır. Bu çözeltinin pH’ı ve iyonik gücü (tuz konsantrasyonu), moleküllerin bağlanmasını ve salınmasını (elüsyon) yönlendiren hassas bir şekilde kontrol edilen kritik parametrelerdir.20

Ayırma süreci şu adımlarla ilerler:

  1. Yükleme/Bağlanma: İyon değiştirici içeren kolon, ilk olarak belirli bir pH’daki bir tamponla dengelenir. Daha sonra numune karışımı kolona verilir. Numunedeki, reçinenin yüküyle zıt net yüke sahip moleküller, karşı iyonların yerini alarak durağan faza bağlanır. Nötr veya benzer yüklü moleküller ise tutulmadan kolondan geçer.18
  2. Elüsyon: Bağlanan moleküller daha sonra kolondan seçici olarak salınır. Bu, genellikle iki yoldan biriyle hareketli fazın bileşiminin değiştirilmesiyle gerçekleştirilir:
    • Artan İyonik Güç: Kolondan artan bir tuz konsantrasyonu gradyanı geçirilir. Tuz iyonları, reçine üzerindeki yüklü bölgeler için bağlı analit molekülleriyle rekabet eder ve analitlerin salınmasına yol açar. Daha zayıf iyonik etkileşimlere sahip moleküller daha düşük tuz konsantrasyonlarında, daha güçlü etkileşimlere sahip olanlar ise daha yüksek tuz konsantrasyonlarında salınır.19
    • pH Değişimi: Tamponun pH’ının değiştirilmesi, analit moleküllerinin (özellikle proteinlerin) net yükünü değiştirir. Örneğin, katyon değişiminde pH’ın artırılması, bağlı bir proteinin pozitif yükünü nötralize edebilir, bu da onun negatif reçineye olan afinitesini kaybetmesine ve kolondan salınmasına neden olur.21

Proteinler gibi amfoterik moleküller için ayırma stratejisi, proteinin izoelektrik noktasına (pI) göre belirlenir. pI değerinin üzerindeki bir pH’da protein net olarak negatif yüklüdür ve bir anyon değiştiriciye bağlanır. pI değerinin altındaki bir pH’da ise net olarak pozitif yüklüdür ve bir katyon değiştiriciye bağlanır.21 Bu durum, IEC’nin işleyiş prensibinin, bir molekülün kimliğinin ve davranışının (yükünün) harici bir çevresel faktör (pH) tarafından hassas bir şekilde manipüle edilebildiği dikkate değer bir özgüllük ve kontrol sistemi ortaya koyduğunu gösterir. Bir proteinin net yükü, asidik ve bazik amino asit kalıntılarının iyonizasyon durumuna bağlıdır ve bu durum, çevresindeki tampon çözeltinin pH’ı ile doğrudan belirlenir. Tek bir protein, sadece pH’ın pI değerine göre ayarlanmasıyla bir katyon (katyon değiştiriciye bağlanarak) veya bir anyon (anyon değiştiriciye bağlanarak) gibi davranacak şekilde ayarlanabilir. Bu, sistemin molekülleri sadece statik bir özelliğe göre ayırmadığını, bunun yerine dinamik bir özelliğin (yük), istenen bir sonuca (bağlanma veya salınma) ulaşmak için harici bir kontrol (pH) ile modüle edildiğini gösterir. Bir molekülün “davranışının” çevresi tarafından yönetildiği bu sofistike, kural tabanlı sistem, fiziksel yasaların derinlemesine düzenli ve amaçlı bir şekilde tertip edildiğine işaret eder.

Güncel Araştırmalardan Bulgular

IEC, yüksek kapasitesi ve çözünürlüğü sayesinde biyofarmasötik endüstrisinde terapötik proteinlerin, peptitlerin ve monoklonal antikorların (mAb’ler) büyük ölçekli saflaştırılması için temel bir tekniktir.3 Genellikle çok aşamalı bir saflaştırma protokolünde yakalama, ara saflaştırma veya parlatma adımı olarak kullanılır.23 Araştırmalar, ayırma verimliliğini ve işlem hacmini artırmak için geliştirilmiş özelliklere (parçacık boyutu, gözeneklilik) sahip yeni iyon değişim ortamları geliştirmeye odaklanmaya devam etmektedir.22 IEC’nin Yüksek Performanslı Sıvı Kromatografisi (HPLC) gibi diğer tekniklerle birleştirilmesi, analitik ve preparatif amaçlar için standart hale gelmiştir.25 Ayrıca, IEC, amino asitler ve nükleotitlerden büyük protein komplekslerine kadar geniş bir molekül yelpazesinin ayrılması için klinik teşhis ve analitik kimyada yaygın olarak kullanılmaktadır.3

Elektrik Alanında Göç: Kağıt Elektroforezi

Temel Kavramlar ve İşleyiş Mekanizması

Elektroforez, yüklü parçacıkların uygulanan bir elektrik alanın etkisi altında iletken bir ortamda göç etmesi ilkesine dayanan bir tekniktir.28 Ayırım, moleküllerin net yüklerine, boyutlarına ve şekillerine göre belirlenen farklı göç hızlarına dayanır.31

Sistemin temel bileşenleri şunlardır:

  • Güç Kaynağı: Göçü sağlayan doğru akım (DC) elektrik alanını sağlar.32
  • Destek Ortamı: Kağıt elektroforezinde, bir filtre kağıdı şeridi (veya selüloz asetat), moleküllerin içinden hareket ettiği matris olarak görev yapar.28
  • Tampon Çözelti: Kağıt, iki kritik işlevi yerine getiren bir tamponla doyurulur: elektrik akımını iletir ve sabit bir pH’ı koruyarak analit moleküllerinin yükünün ayırma sırasında sabit kalmasını sağlar.29
  • Elektroforez Tankı: Kağıt şeridinin uçlarının daldırıldığı tampon rezervuarlarını ve güç kaynağına bağlı elektrotları (anot ve katot) içerir.28

Ayırma mekanizması şu şekilde işler: Numune, tamponla doyurulmuş kağıt şeridi üzerine dar bir bant halinde uygulanır.28 Bir elektrik alanı uygulandığında, yüklü moleküller üzerinde bir elektrostatik kuvvet (F=Eq, burada E alan şiddeti ve q net yüktür) oluşur ve moleküller göç etmeye başlar.29 Pozitif yüklü moleküller (katyonlar) negatif elektroda (katot) doğru hareket ederken, negatif yüklü moleküller (anyonlar) pozitif elektroda (anot) doğru hareket eder.30

Göç hızı (elektroforetik hareketlilik), molekülün net yükü ve uygulanan alan şiddeti ile doğru orantılı, boyutu ve ortamın sürtünme direnci ile ters orantılıdır.29 Sonuç olarak, daha yüksek yük/kütle oranına sahip moleküller daha hızlı hareket eder, bu da zamanla farklı bantlar veya bölgeler halinde ayrılmalarına yol açar. Yük ve boyutun yanı sıra, tampon pH’ı (amino asitler ve proteinler gibi amfolitlerin net yükünü belirler), tamponun iyonik gücü, uygulanan voltaj ve elektroendozmoz (tampon iyonlarının sabit desteğe göre hareketi, bu da numune göçünü engelleyebilir) gibi faktörler de ayrımı etkiler.29

Elektroendozmoz olgusu, bir sistemin işleyişinin hesaba katılması gereken çoklu, etkileşimli kuvvetleri nasıl içerdiğinin güçlü bir örneğidir. Bu durum, “amaçlanan” sürecin (analit göçü) tek başına gerçekleşmediğini, daha karmaşık bir kuvvetler etkileşiminin bir parçası olduğunu gösterir. Elektroforezdeki birincil kuvvet, yüklü analit üzerindeki elektrik alanıdır. Ancak, destek ortamının (kağıt, agaroz) kendisi de sabit negatif yüklere (örneğin sülfat grupları) sahiptir. Bu sabit yükler, tampondaki pozitif iyonları çekerek hareketli bir katyon tabakası oluşturur. Elektrik alanı uygulandığında, bu pozitif yük tabakası katoda doğru hareket eder. Tamponun bu hareketi, anyonik analitlerin anoda doğru göçüne karşı koyan bir “akım” veya “akış” oluşturur. Dolayısıyla, bir anyonun gözlemlenen son göçü, anoda doğru elektroforetik hareketinin, katoda doğru olan zıt elektroendozmotik akıştan çıkarılmasıyla elde edilen net sonuçtur. Bu, sistemin sonucunun, hepsi aynı anda hassas kurallara göre işleyen işbirlikçi ve karşıt kuvvetlerin bir vektör toplamı olduğunu ortaya koyar. Bu karmaşıklık, basit, doğrusal bir neden-sonuç ilişkisinden ziyade, bütüncül ve entegre bir yönetim sistemine işaret eder.

Güncel Araştırmalardan Bulgular

Kağıt ve selüloz asetat elektroforezi, özellikle serum proteinlerinin analizi için klinik laboratuvarlarda on yıllardır standart yöntemler olmuştur.28 Bu teknik, serum proteinlerini fraksiyonlara (albümin, alfa, beta, gama globülinler) ayırmak için kullanılır ve gama bölgesinde belirgin, keskin bir bant (“M-spike”) ile tanımlanan multipl miyelom gibi monoklonal gamopatileri taramak ve izlemek için kullanılır.37

Temel bir yöntem olmasına rağmen, kağıt elektroforezi birçok analitik uygulamada yerini büyük ölçüde yüksek çözünürlüklü tekniklere, özellikle de Kapiler Elektroforez’e (CE) bırakmıştır. CE, ayrımı dar bir erimiş silika kapiler içinde gerçekleştirir ve hız, çözünürlük, otomasyon ve azaltılmış numune tüketimi açısından önemli avantajlar sunar.34 CE, protein analizi, ilaç taraması ve DNA analizinde geniş klinik uygulamalara sahiptir ve bölge elektroforezi prensiplerinden doğrudan teknolojik bir dönüşümü temsil eder.36

Son araştırmalar, özellikle kanser tedavisinde kullanılan terapötik monoklonal antikorların (t-mAb’ler) ortaya çıkmasıyla elektroforez sonuçlarının dikkatli bir şekilde yorumlanması gerektiğini vurgulamaktadır. Bu terapötik ajanlar, bir elektroforegramda monoklonal bantlar olarak görünebilir ve bir hastalık durumunu taklit edebilir. Doğru teşhis artık, yanlış yorumlamayı önlemek için sonuçların hastanın ilaç geçmişiyle ilişkilendirilmesini gerektirmektedir.41

Uçuculuğa Dayalı Ayrım: Gaz Kromatografisi (GC)

Temel Kavramlar ve İşleyiş Mekanizması

Gaz Kromatografisi (GC), bozunmadan buharlaştırılabilen bileşikleri ayırmak ve analiz etmek için kullanılan güçlü bir kromatografik tekniktir.42 Ayırım, buharlaştırılmış bileşenlerin gaz halindeki bir hareketli faz ile bir kolon içinde bulunan durağan faz arasında farklı şekilde dağılmasına dayanır.44

Sistemin ana bileşenleri şunlardır:

  • Taşıyıcı Gaz (Hareketli Faz): Kimyasal olarak inert bir gaz (örneğin, helyum, azot, hidrojen) sistemden sabit bir hızla akar ve analit moleküllerini kolon boyunca taşımakla görevlidir. GC’de hareketli fazın analitlerle etkileşime girmemesi ve tek işlevinin taşıma olması kritik bir özelliktir.42
  • Enjeksiyon Portu: Numune, ısıtılmış enjeksiyon portuna enjekte edilir, burada hızla buharlaştırılır ve taşıyıcı gazla karıştırılır.10
  • Kolon (Durağan Faz): Ayırımın gerçekleştiği sistemin kalbidir. Kolon, sıcaklığı kontrol edilen bir fırın içinde bulunur.10

Paketli kolonlar ve çok daha yüksek çözünürlük sunan kapiler kolonlar olmak üzere iki ana türü vardır.42

  • Dedektör: Bileşenler kolondan farklı zamanlarda çıktıkça, bir elektrik sinyali üreten bir cihaz tarafından tespit edilirler. Yaygın dedektörler arasında Alev İyonlaşma Dedektörü (FID) ve Termal İletkenlik Dedektörü (TCD) bulunur.42 Çıktı, dedektör yanıtının zamana karşı grafiği olan bir kromatogramdır.

Ayırma mekanizması, bileşenlerin buharlaştırıldıktan sonra taşıyıcı gaz tarafından kolona sürüklenmesiyle başlar. Bileşenlerin kolon boyunca hareket hızı iki ana faktör tarafından belirlenir:

  1. Uçuculuk (Kaynama Noktası): Daha uçucu (daha düşük kaynama noktasına sahip) bileşenler gaz fazında daha fazla zaman geçirir ve kolon boyunca daha hızlı hareket eder.10
  2. Durağan Faza Afinite: Sıvı durağan faz ile daha güçlü etkileşime giren (örneğin, çözünürlüğü daha yüksek olan) bileşenler, bu fazda “çözünmüş” halde daha fazla zaman geçirir ve kolon boyunca daha yavaş hareket eder.45

Hareketli ve durağan fazlar arasındaki bu sürekli dağılım süreci, farklı bileşenlerin kolondan karakteristik zamanlarda (alıkonma zamanları) çıkmasıyla sonuçlanır. Kolon fırınının sıcaklığı kritik bir parametredir. Sıcaklık sabit tutulabilir (izotermal) veya zamanla artacak şekilde programlanabilir (gradyan). Sıcaklık programlaması, geniş bir kaynama noktası aralığına sahip bileşenleri içeren karmaşık karışımların ayrılması için esastır.10

GC’de hareketli fazın benzersiz rolü – ayırım kimyasında aktif bir katılımcı olmaktan ziyade tamamen pasif bir taşıyıcı olması – derin bir tasarım ilkesini vurgular. Ayırım, tamamen analitin içsel özellikleri (uçuculuk) ile tek bir aktif bileşenle (durağan faz) etkileşimi arasındaki ve tümü hassas bir şekilde kontrol edilen harici bir koşul (sıcaklık) ile yönetilen bir etkileşimle düzenlenir. Sıvı kromatografisinde hareketli faz aktif bir çözücüdür ve ayırım, analitin hem durağan hem de hareketli faza olan göreceli afinitesine bağlıdır. GC ise temelden farklıdır; taşıyıcı gaz inerttir ve analit ile etkileşime girmez. Bu, sistemin mantığını basitleştirir. Tüm ayırma süreci, analit molekülünün iki eğilimi arasındaki bir rekabete indirgenir: gaz fazına girme eğilimi (sıcaklık ve kendi kaynama noktasının bir fonksiyonu) ve durağan faz ile etkileşime girme eğilimi. Bu zarif basitleştirme, sıcaklığın hassas kontrolüne büyük önem verir. Sıcaklık programı, karışımdaki her bileşen için bu iki eğilimin dengesini zamanla belirleyen ana kontrolör haline gelir. Bu durum, ayırımın son derece rafine ve minimalist bir tasarımla elde edildiği bir sisteme işaret eder.

Güncel Araştırmalardan Bulgular

GC, özellikle Kütle Spektrometresi (GC-MS) ile birleştirildiğinde, yüksek hassasiyeti ve seçiciliği nedeniyle çevre analizlerinde baskın bir tekniktir.42 Kalıcı organik kirleticilerin (POP’lar), pestisitlerin ve diğer kirleticilerin hava, su ve toprak numunelerindeki tespiti ve miktarının belirlenmesi için yaygın olarak kullanılmaktadır.48

Son uygulamalar, ortaya çıkan yeni kirleticilerin tanımlanması ve miktarının belirlenmesine odaklanmaktadır. Örneğin, GC tabanlı yöntemler, çevresel numunelerdeki mikroplastiklerin analizi için geliştirilmekte ve uygulanmaktadır; bu genellikle polimeri tanımlanabilir uçucu bileşiklere ayırmak için bir piroliz adımı (Py-GC-MS) içerir.51 Tekniğin hızı, hassasiyeti (iz seviyelerine kadar) ve doğruluğu, onu adli tıp (ilaç analizi), gıda güvenliği ve petrokimyasallar ile uçucu yağların analizi gibi çeşitli alanlarda vazgeçilmez kılmaktadır.42



Tablo 1: Analitik Ayrım Tekniklerinin Karşılaştırmalı Özeti

Teknik Temel Prensip Hareketli Faz Durağan Faz İtici Güç / Koşul Ayrım için Anahtar Moleküler Özellik Birincil Uygulama Alanı
Kağıt Kromatografisi İki sıvı faz arasında dağılım (partisyon) Sıvı çözücü Selüloz kağıda adsorbe edilmiş su Kılcal Etki Farklı çözünürlük / Polarite Amino asit, pigment ayrımı; Eğitim amaçlı kullanım
İyon Değişim Kromatografisi Yüklü moleküllerin zıt yüklü durağan faza tersinir bağlanması Sulu tampon Yüklü fonksiyonel gruplara sahip reçine Basınçlı akış Net elektriksel yük Protein, nükleik asit, iyon saflaştırılması ve analizi
Kağıt Elektroforezi Elektrik alanında yüklü moleküllerin farklı hızlarda göçü Tampon çözelti (iletken ortam) Tamponla doyurulmuş kağıt Elektrik Alanı Yük/kütle oranı Serum protein analizi, klinik teşhis
Gaz Kromatografisi Uçucu bileşiklerin gaz ve durağan faz arasında dağılımı İnert taşıyıcı gaz Katı destek üzerine kaplanmış sıvı veya katı Basınçlı gaz akışı ve sıcaklık Uçuculuk (kaynama noktası) ve durağan faza afinite Çevre analizleri, adli tıp, gıda güvenliği



Kavramsal Analiz

Nizam, Gaye ve Sanat Analizi

İncelenen her bir analitik teknik, bir nizam (düzen) ilkesi üzerine kurulmuştur. Moleküller, sistem içinde rastgele değil, içsel özelliklerine göre tasnif edilir. Bu tasnif süreci kaotik olmaktan uzak, Rf​ değerleri, alıkonma zamanları veya elüsyon profilleri gibi öngörülebilir ve ölçülebilir bir düzeni takip eder. Sistemlerin, çözünürlük, yük, yük/kütle oranı veya uçuculuk gibi belirli özelliklere karşı hassas olacak şekilde tertip edilmiş olması, işleyişin temelinde yatan bir nizama işaret eder.

Bu süreçlerin tutarlı sonucu olan bir karışımın saf bileşenlerine ayrıştırılması, bir gaye (amaç) mevcudiyetine işaret eder. Sistemler, adeta bir karışımın içeriğini “tanımlama” hedefine ulaşacak şekilde düzenlenmiştir. Bu fiziksel etkileşimlerin, bir ayrım ve tanıma süreciyle sonuçlanacak şekilde tertip edilmiş olması dikkat çekicidir.

Basit bileşenlerin (kağıt, reçine, tampon, inert gaz) sofistike bir görevi yerine getirebilen işlevsel bir bütün oluşturmak üzere özel bir şekilde bir araya getirilmesi, bir sanat göstergesidir. Bir kromatografi kolonunun hassas bir şekilde doldurulması veya kararlı bir pH gradyanının oluşturulması 28, bütünün, tek tek parçalarında bulunmayan bir kabiliyete (ayırma) sahip olduğu düzenlemeler olarak görülebilir. Bu durum, “Bu cansız maddeler, böylesine karmaşık ve amaçlı bir işlevi yerine getirmek üzere nasıl bir araya getirilmiş ve düzenlenmiştir?” sorusunu akla getirir.

İndirgemeci Dilin Eleştirisi: Kanunlar Fail Değil, Vasıftır

Bilimsel literatürde sıkça rastlanan “kılcal etki çözücüyü hareket ettirir” 6 veya “elektrik alanı bir kuvvet uygular” 29 gibi ifadeler, aslında açıklayıcı birer kısayoldur. Bu dil, nedenselliğin eksik bir şekilde atfedilmesine yol açabilir. Fiziksel yasalar (örneğin, Coulomb Yasası, termodinamik ilkeleri) kendi başlarına bir iradeye veya fiil gücüne sahip değildir. Onlar fail değil, sistemin işleyiş tarzını, yani usulü tanımlayan birer vasıftır. Yasa, bir elektrik alanında yüklü bir parçacığın hareketinin nasıl etkilendiğini tarif eder; parçacığı kendi başına hareket ettirmez. Yasa, fiilin tutarlı ve düzenli modelinin bir açıklamasıdır, fiilin kaynağı değildir. Dolayısıyla, yasa, fiilin faili olarak değil, fiilin icra edildiği tutarlı modelin tanımı olarak anlaşılmalıdır. Bu durum, bu işleyiş gramerini tesis eden ve sürdüren harici bir Fail’in gerekliliğine örtük bir şekilde işaret eder.

Hammadde ve Sanat Ayrımı Analizi

Her bir teknik, “hammadde” ile “sanat” arasındaki fark üzerinden analiz edilebilir. Hammadde, sistemi oluşturan temel bileşenlerdir: selüloz lifleri ve su (Kağıt Kromatografisi), polistiren tanecikleri ve yüklü fonksiyonel gruplar (IEC), inert gaz ve kaplanmış silika (GC).8 Bu bileşenlerin hiçbirinin tek başına karmaşık bir karışımı ayırma kabiliyeti yoktur.

“Ayırma kabiliyeti” gibi yeni bir işlev, ancak bu hammaddeler belirli ve düzenli bir sistem (“sanat”) içinde bir araya getirildiğinde ortaya çıkan bir özelliktir. Örneğin, selüloz lifleri tek başına bir polimerdir; ancak bir tabaka halinde biçimlendirilip bir çözücü ile belirli bir ilişki içine konulduğunda, sistem kromatografi yapma yeteneği kazanır. Bu ayrım, temel soruları gündeme getirir: Selülozda, suda veya çözücüde tek başına bulunmayan “ayırma” özelliği, bu unsurlar bu özel düzenlemede bir araya getirildiğinde nereden kaynaklanmaktadır? Herhangi bir içsel plandan yoksun olan cansız bileşenler, hassas ve öngörülebilir bir ayırma protokolünü yürüten bir sistemin parçası haline nasıl gelmiştir? Bu sorular, analitik sistemin (“sanat eseri”) işlevsel özelliklerinin, onu oluşturan “hammaddelerin” özelliklerine indirgenemeyeceğini düşündürür. Bu durum, sanatın ve planın, maddelerin üzerine bilgi ve irade sahibi harici bir kaynaktan yüklendiğini akla getirir.

Sonuç

Bu raporda incelenen dört analitik ayrım tekniği, farklı mekanik temellere dayanmalarına rağmen, hepsinde ortak bir nizam, gaye ve sanat temasının gözlemlenebildiğini ortaya koymuştur. Her bir sistem, ayırma ve analiz gibi sofistike bir hedefe ulaşmak için fiziksel yasaların hassas bir düzenleme içinde kullanıldığı birer tezahürdür.

Bilimsel yöntemin, bu süreçlerin “nasıl” işlediğini – mekanizmaları, etkileşimleri ve denklemleri – aydınlatmada ne kadar güçlü olduğu gösterilmiştir. Veriler, derin bir tutarlılık ve karmaşık bir işleyişe sahip bir evreni gözler önüne sermektedir. Bununla birlikte, bu karmaşık sistemlerin ve uydukları yasaların “kim tarafından” bu kadar hassas bir şekilde kurulduğu ve düzenlendiği sorusu, sunulan kanıtların teşvik ettiği ancak ampirik bilimin sınırları içinde cevaplayamadığı bir sorudur. Bu deliller ışığında nihai kararı vermek, okuyucunun kendi aklına ve vicdanına bırakılmıştır.

Kaynakça

Albayrak İskender, N. (2025). In vitro assessment of antimicrobial activity in various commercial essential oils. Turkish Journal of Biodiversity, 8(1), 46-51.

Choy, K. W., et al. (2022). Positive findings in repeated serum protein electrophoresis tests after an initial negative result in patients without prior history of plasma cell disorders: a pilot retrospective database study. Journal of Laboratory and Precision Medicine.

Fathima, S., Hakeem, W. G. A., Shanmugasundaram, R., & Selvaraj, R. K. (2022). Necrotic enteritis in broiler chickens: A review on the pathogen, pathogenesis, and prevention. Microorganisms, 10(10), 1958.

Giddings, J. C. (2019). Unified separation science. John Wiley & Sons.

James, A. T., & Martin, A. J. P. (1952). Gas-liquid partition chromatography: the separation and micro-estimation of volatile fatty acids from formic acid to dodecanoic acid. Biochemical Journal, 50(5), 679–690.

Kiliç, M., & Yücel, E. (2024). Study of microplastic accumulation in halophyte plants and macroalgae: A critical review. Journal of the Black Sea/Mediterranean Environment.

Kostic, D. A., et al. (2025). Advances in chromatography: contemporary techniques and applications. Analytical Letters.

Poole, C. F. (2021). Planar chromatography. In Encyclopedia of Analytical Science (3rd ed.). Elsevier.

Sarpong, K., & Wiencek, J. (2018). New approaches to an old testing process: Quality improvements in serum protein electrophoresis (SPEP) analysis and interpretation to reduce unnecessary follow-up testing. HVPAA National Conference.

Scott, R. P. W. (2018). Introduction to analytical gas chromatography. CRC press.

Ståhlberg, J. (2018). Review of applications of capillary electrophoresis for clinical analysis. ResearchGate.

Tiwari, A., & Sharma, V. (2024). Recent Advances in Microfluidic Paper-Based Analytical Devices toward High-Throughput Screening. Micromachines, 15(7), 835.

Wilson, I. D. (2022). Planar Chromatography – Current Practice and Future Prospects. Journal of Chromatography A.

Yilmaz, H., et al. (2020). Purifying microplastic pollutions in waters with nanomagnetites synthesized from iron oxide. Global Scientific Journal, 8(4).

Alıntılanan çalışmalar

  1. Kromatografiye Giriş, Yüksek Performanslı Sıvı Kromatografi Kullanımında Basit İpuçları - DergiPark, erişim tarihi Eylül 23, 2025, https://dergipark.org.tr/tr/download/article-file/666394
  2. Separation techniques: Chromatography - PMC, erişim tarihi Eylül 23, 2025, https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC5206469/
  3. Ion exchange chromatography: A comprehensive review - GSC Online Press, erişim tarihi Eylül 23, 2025, https://gsconlinepress.com/journals/gscbps/sites/default/files/GSCBPS-2025-0127.pdf
  4. TiKiPedi Yayın Anayasası.docx
  5. Paper Chromatography: A Review - JETIR.org, erişim tarihi Eylül 23, 2025, https://www.jetir.org/papers/JETIRDQ06066.pdf
  6. Chromatography: Principle, Types, Steps, Uses, Diagram - Microbe Notes, erişim tarihi Eylül 23, 2025, https://microbenotes.com/chromatography-principle-types-and-applications/
  7. AMİNO ASİTLERİN KAĞIT KROMATOGRAFİSİ, erişim tarihi Eylül 23, 2025, https://avys.omu.edu.tr/storage/app/public/ediraman/139118/Biyokimya%20Lab.,%20%204.%20Hafta%20.pdf
  8. Paper Chromatography: A Modern Review of Techniques and Applications - IJNRD, erişim tarihi Eylül 23, 2025, https://ijnrd.org/papers/IJNRD2410045.pdf
  9. Düzlemsel kromatagrafi yöntemleri: - •ince-tabaka kromatografi (TLC), erişim tarihi Eylül 23, 2025, https://acikders.ankara.edu.tr/mod/resource/view.php?id=83313
  10. Kromatografik Yöntemlerin Prensipleri, erişim tarihi Eylül 23, 2025, https://avys.omu.edu.tr/storage/app/public/eatmaca/119888/07%20Kromatografik%20Y%C3%B6ntemlerin%20Prensipleri.pdf
  11. Planar Chromatography – Current Practice and Future Prospects …, erişim tarihi Eylül 23, 2025, https://www.researchgate.net/publication/365800092_Planar_Chromatography_-_Current_Practice_and_Future_Prospects
  12. Recent Advances in Microfluidic Paper-Based Analytical Devices …, erişim tarihi Eylül 23, 2025, https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC7412548/
  13. Advancements and challenges in microfluidic paper-based analytical devices: design, manufacturing, sustainability, and field applications - Frontiers, erişim tarihi Eylül 23, 2025, https://www.frontiersin.org/journals/lab-on-a-chip-technologies/articles/10.3389/frlct.2024.1467423/full
  14. Unveiling the state of the art: a systematic review and meta-analysis of paper-based microfluidic devices - Frontiers, erişim tarihi Eylül 23, 2025, https://www.frontiersin.org/journals/bioengineering-and-biotechnology/articles/10.3389/fbioe.2024.1421831/full
  15. Turning the Page: Advancing Paper-Based Microfluidics for Broad Diagnostic Application | Chemical Reviews - ACS Publications, erişim tarihi Eylül 23, 2025, https://pubs.acs.org/doi/10.1021/acs.chemrev.7b00024
  16. Paper-based microfluidics for DNA diagnostics of malaria in low resource underserved rural communities | PNAS, erişim tarihi Eylül 23, 2025, https://www.pnas.org/doi/10.1073/pnas.1812296116
  17. İyon Değişim Kromatografisi Genel Bakış (Ion Exchange …, erişim tarihi Eylül 23, 2025, https://labakademi.com/iyon-degisim-kromatografisi-genel-bakis-ion-exchange-chromatography/
  18. İyon değişim kromatografisi reçinesi nasıl çalışır? - SSS - Taiyuan Lanlang Teknoloji Sanayi A.Ş., erişim tarihi Eylül 23, 2025, https://tr.alkalinewaterfiltersupplier.com/info/how-does-ion-exchange-chromatography-resin-wor-46334276.html
  19. (PDF) Ion exchange chromatography: A comprehensive review - ResearchGate, erişim tarihi Eylül 23, 2025, https://www.researchgate.net/publication/390988603_Ion_exchange_chromatography_A_comprehensive_review
  20. Proteinlerin Kromatografik Yöntemlerle Saflaştırılması - DergiPark, erişim tarihi Eylül 23, 2025, https://dergipark.org.tr/tr/download/article-file/1186480
  21. İyon değişim kromatografisi teknikleri, proteinlerin iyonik elüsyonla kolondan, erişim tarihi Eylül 23, 2025, https://acikders.ankara.edu.tr/mod/resource/view.php?id=2734
  22. Introduction to Ion Exchange Chromatography - Bio-Rad, erişim tarihi Eylül 23, 2025, https://www.bio-rad.com/en-us/applications-technologies/introduction-ion-exchange-chromatography?ID=LUSN6ZE8Z
  23. Ion Exchange Chromatography, erişim tarihi Eylül 23, 2025, https://research.fredhutch.org/content/dam/stripe/hahn/methods/biochem/Ion_Exchange_Chromatography_Handbook.pdf
  24. Vrije Universiteit Brussel Performance Limits and Design Aspects for Spatial Comprehensive Three-dimensional Isoelectric Focusin, erişim tarihi Eylül 23, 2025, https://researchportal.vub.be/files/86714905/HTC_17_Book_of_Abstracts_May_2022.pdf
  25. 247 questions with answers in ACTIVE PHARMACEUTICAL INGREDIENTS | Science topic - ResearchGate, erişim tarihi Eylül 23, 2025, https://www.researchgate.net/topic/Active-Pharmaceutical-Ingredients
  26. 5 proceedings book - mesmap, erişim tarihi Eylül 23, 2025, https://www.mesmap.com/FileUpload/ks831353/File/mesmap-2019..pdf
  27. Proteomics: A Promising Approach for Cancer Research - ResearchGate, erişim tarihi Eylül 23, 2025, https://www.researchgate.net/profile/Ozaifa-Kareem/publication/368830764_Proteomics_approaches_in_the_identification_of_cancer_biomarkers_and_drug_discovery/links/6447cfd48ac1946c7a4d681c/Proteomics-approaches-in-the-identification-of-cancer-biomarkers-and-drug-discovery.pdf
  28. Sigma 27, - Sigma Journal of Engineering and Natural Sciences, erişim tarihi Eylül 23, 2025, https://sigma.yildiz.edu.tr/storage/upload/pdfs/1636124021-tr.pdf
  29. (PDF) Elektroforezin Temelleri ve Türleri - ResearchGate, erişim tarihi Eylül 23, 2025, https://www.researchgate.net/publication/334536243_Elektroforezin_Temelleri_ve_Turleri
  30. Electrophoresis - StatPearls - NCBI Bookshelf, erişim tarihi Eylül 23, 2025, https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK585057/
  31. Jel Elektroforezi (Makale) | Biyoteknoloji - Khan Academy, erişim tarihi Eylül 23, 2025, https://tr.khanacademy.org/science/ap-biology/gene-expression-and-regulation/biotechnology/a/gel-electrophoresis
  32. YAKIN DOĞU ÜNİVERSİTESİ, erişim tarihi Eylül 23, 2025, https://docs.neu.edu.tr/library/6347885389.pdf
  33. A Review of Paper Electrophoresis - ijrpr, erişim tarihi Eylül 23, 2025, https://ijrpr.com/uploads/V5ISSUE8/IJRPR32027.pdf
  34. Electrophoresis: What does a century old technology hold for the future of separation science? - ResearchGate, erişim tarihi Eylül 23, 2025, https://www.researchgate.net/publication/259590007_Electrophoresis_What_does_a_century_old_technology_hold_for_the_future_of_separation_science
  35. Elektroforez, erişim tarihi Eylül 23, 2025, https://sistem.nevsehir.edu.tr/bizdosyalar/0193398843737a538a134e0ba0b641e8/5.%20hafta%20elektorforez.pdf
  36. Capillary Zone Electrophoresis in the Evaluation of Serum Protein Abnormalities, erişim tarihi Eylül 23, 2025, https://academic.oup.com/ajcp/article-pdf/110/2/248/24883395/ajcpath110-0248.pdf
  37. Understanding and Interpreting Serum Protein Electrophoresis - AAFP, erişim tarihi Eylül 23, 2025, https://www.aafp.org/pubs/afp/issues/2005/0101/p105.html
  38. Positive findings in repeated serum protein electrophoresis tests after an initial negative result in patients without prior history of plasma cell disorders: a pilot retrospective database study - Journal of Laboratory and Precision Medicine, erişim tarihi Eylül 23, 2025, https://jlpm.amegroups.org/article/view/6829/html
  39. Understanding electrophoresis: Principles and applications. - Allied Academies, erişim tarihi Eylül 23, 2025, https://www.alliedacademies.org/articles/peptides-the-tiny-powerhouses-of-biochemistry.pdf
  40. Review of applications of capillary electrophoresis for clinical …, erişim tarihi Eylül 23, 2025, https://www.researchgate.net/publication/237888286_Review_of_applications_of_capillary_electrophoresis_for_clinical_analysis
  41. New approaches to an old testing process: Quality improvements in …, erişim tarihi Eylül 23, 2025, https://hvpaa.org/new-approaches-to-an-old-testing-process-quality-improvements-in-serum-protein-electrophoresis-spep-analysis-and-interpretation-to-reduce-unnecessary-follow-up-testing/
  42. gaz kromatografisi, erişim tarihi Eylül 23, 2025, https://avys.omu.edu.tr/storage/app/public/aslihan.kizildogan/68991/Hafta%208%20GC-MS-SO.pdf
  43. A BRIEF REVIEW ON GAS CHROMATOGRAPHY - IJNRD, erişim tarihi Eylül 23, 2025, https://www.ijnrd.org/papers/IJNRD2212262.pdf
  44. GAZ KROMATOGRAFİSİ, erişim tarihi Eylül 23, 2025, https://acikders.ankara.edu.tr/mod/resource/view.php?id=59022
  45. Gas Chromatography: How It Works and 5 Critical Components - Bitesize Bio, erişim tarihi Eylül 23, 2025, https://bitesizebio.com/28687/carrying-gas-chromatography/
  46. KROMATOGRAFİK TEKNİKLER - Balıkesir Üniversitesi - Kimya Bölümü, erişim tarihi Eylül 23, 2025, https://kimya.balikesir.edu.tr/Seminerler/dokuman/201710105004SibelSandikcioglu.pdf
  47. Gaz Kromatografisi (GC) Nedir, Nerelerde Kullanılır?, erişim tarihi Eylül 23, 2025, https://www.aem.com.tr/gaz-kromatografisi-gc-nedir-nerelerde-kullanilir/
  48. Legacy and Emerging Organic Pollutants in Indoor and Outdoor Environments in Africa: Contamination Levels, Health Risks, and Analytical Techniques - ResearchGate, erişim tarihi Eylül 23, 2025, https://www.researchgate.net/publication/387738436_Legacy_and_Emerging_Organic_Pollutants_in_Indoor_and_Outdoor_Environments_in_Africa_Contamination_Levels_Health_Risks_and_Analytical_Techniques
  49. Chlorpyrifos Draft risk profile - Defra - Citizen Space, erişim tarihi Eylül 23, 2025, https://consult.defra.gov.uk/pops-and-chemicals-in-waste-team/poprc-evaluation-2023/user_uploads/document-1.1-second-draft-risk-profile-on-chlorpyrifos.pdf
  50. Sensing technologies for agroenvironment toward sustainable human healthcare - DOI, erişim tarihi Eylül 23, 2025, https://doi.org/10.1016/B978-0-443-19039-1.00012-2
  51. GSJ: Volume 8, Issue 4, April 2020, Online: ISSN 2320-9186 - Global Scientific Journal, erişim tarihi Eylül 23, 2025, https://www.globalscientificjournal.com/researchpaper/PURIFYING_MICROPLASTIC_POLLUTIONS_IN_WATERS_WITH_NANOMAGNETITES_SYNTHESIZED_FROM_IRON_OXIDE.pdf
  52. Study of microplastic accumulation in halophyte plants … - DergiPark, erişim tarihi Eylül 23, 2025, https://dergipark.org.tr/en/download/article-file/4000232
  53. In vitro assessment of antimicrobial activity in various commercial essential oils, erişim tarihi Eylül 23, 2025, https://www.researchgate.net/publication/393180044_In_vitro_assessment_of_antimicrobial_activity_in_various_commercial_essential_oils
  54. Stingless bee propolis: a comprehensive review of chemical constituents and health efficacy - PMC - PubMed Central, erişim tarihi Eylül 23, 2025, https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC12411399/